El comité tiene por objeto garantizar la protección de los derechos humanos y derechos fundamentales de los participantes de las investigaciones y de los reportes de caso, o material de investigación para publicación que los involucren, que se desarrollen en el Hospital Alma Máter de Antioquia, basados en la aplicación de los estándares éticos en investigación establecidos en las normas nacionales e internacionales, en las que participan seres humanos, incluida la investigación que utiliza material humano o datos identificables.

El CEI se fundamenta en la Declaración Universal de los Derechos Humanos, los derechos fundamentales de la constitución política de Colombia, las resoluciones 8430 de 1993, 2378 de 2008, 1124 de 2016, la ley 2287 de 2023 y los estándares éticos y científicos en investigación con seres humanos del soft law como la Declaración de Helsinki, la Declaración de Taipéi de la Asociación Médica Mundial (AMM), las Pautas Éticas Internacionales para la Investigación Biomédica en Seres Humanos del Consejo de Organizaciones Internacionales de las Ciencias Médicas (CIOMS), las recomendaciones de la Organización Mundial de la Salud (OMS), de la UNESCO y de la Buena Práctica Clínica y Normas ICH de la Conferencia Internacional de Armonización de Requisitos Técnicos para el registro de productos Farmacéuticos para Uso Humano, del Convenio de Derechos Humanos y Biomedicina del Consejo de Europa y las normas nacionales e internacionales que las modifiquen o sustituyan. Así mismo, las normas deontológicas como la Ley 23 de 1981, Ley 911 de 2004, Ley 1090 de 2006, Ley 841 de 2003, y las establecidas para todos los profesionales del sector salud en lo concerniente a la investigación con seres humanos.